財經國家財經指標【柳三變專欄】《自然》發表...

【柳三變專欄】《自然》發表新冠起源的最新發現

Date:

中國疾病預防控制中心 (China CDC) 的研究人員發表了一份備受期待的分析結果,分析結果是在 COVID-19 大流行的最初幾週,在中國武漢的一個濕貨市場收集的拭抹樣本以及基礎數據,自疫情爆發以來,國際研究界一直在呼籲。迪亞尼·劉易斯 馬克斯·科茲洛夫& 瑪麗安娜倫哈羅(Dyani Lewis, Max Kozlov & Mariana Lenharo)<來自武漢市場的 COVID 起源數據公佈:科學家的看法>(COVID-origins data from Wuhan market published: what scientists think)指出,「對中國拭抹樣本進行的首次同行評審分析證實,SARS-CoV-2 檢測呈陽性的樣本中存在動物 DNA。」(First peer-reviewed analysis of the Chinese swabs confirms animal DNA was present in samples that tested positive for SARS-CoV-2.)

文 / 柳三變  綜合報導

動物可能是一種病毒的中間宿主

該分析於 4 月 5 日發表在《自然》雜誌上,證實來自華南海鮮批發市場的拭抹樣本——長期以來一直與新冠大流行的開始有關——含有野生動物的遺傳物質,並檢測出 SARS-CoV-2 呈陽性。這表明動物可能是一種病毒的中間宿主,這種病毒會擴散到人類身上。但研究人員表示,最新發現仍未能提供 SARS-CoV-2 起源於動物對人類的溢出事件的確切證據。(由前中國疾病預防控制中心主任喬治高領導的研究作者沒有回應《自然》新聞團隊的評論請求,該團隊在編輯上獨立於《自然》期刊團隊。)

COVID 起源報告引發了關於主要基因組中心 GISAID 的爭論

儘管如此,研究人員表示,已存儲在開放存儲庫中的基因組數據的發布至關重要——因為它將允許進一步分析,從而提供有關大流行起源的線索。「這是自大流行病出現以來我們擁有的最重要的數據集之一,」巴黎法國國家科學研究中心的進化生物學家弗洛倫斯·德巴爾說,他所在的團隊因發表論文而引起爭議自己分析中國疾控中心上個月的數據。「它們的存在是因為當時做了正確的事情。」

進化病毒學家傑西·布魯姆 (Jesse Bloom) 說,儘管 2020 年 1 月收集的拭抹樣本提供了有關市場上有哪些動物的有用信息,但還需要更早的樣本才能找到大流行的起源。「如果我們了解 SARS-CoV-2 的確切起源,我懷疑它會來自 2019 年 12 月初或 11 月或更早的病例或事件的新信息,」弗雷德哈欽森癌症研究中心的布盧姆說中心位於華盛頓州西雅圖。

野生動物材料對 SARS-CoV-2 檢測呈陽性

這篇論文是對這些市場樣本發表的一系列分析中的最新一篇,也是第一個接受同行評審的論文。這些發現與單獨的預印本分析一致,即拭抹樣本包含來自野生動物和 SARS-CoV-2 的遺傳數據。但這些環境樣本並不能證實在場的任何動物都感染了該病毒。

最新報告背後的中國團隊於 2022 年 2 月發布了其研究的預印本版本,其中不包括對拭抹樣本中動物遺傳物質的分析,也沒有公開基礎序列數據。包括 Débarre 在內的團隊在在線基因組學數據庫 GISAID 中找到了中國疾控中心的拭抹樣本數據,並在研究資料庫 Zenodo 3上發表了自己的分析。該報告確定了拭抹樣本中的野生動物材料對 SARS-CoV-2 檢測呈陽性,並指出包括浣熊在內的動物是感興趣的物種。

在籠子的柵欄後面看到一隻浣熊狗

最新報告支持了關於 COVID-19 大流行如何開始的兩種相互競爭的理論之一。關於它是否具有自然起源(一種病毒從動物傳染給人類)或武漢病毒研究所的實驗室洩漏引起的爭論一直很激烈。華南市場一直處於自然起源理論的中心,因為已知最早的幾個 COVID-19 病例都與該市場有關。已知在那裡出售的動物是稱為 sarbecoviruses 的呼吸道病毒的宿主,其中包括 SARS-CoV-2。然而,實驗室洩漏假說在 2021 年獲得了發展勢頭,並沒有被明確排除。

與 Zenodo 報告一樣,最新的論文包含有關市場樣本中存在的哺乳動物基因組序列的詳細信息。作者分析了 60 個 SARS-CoV-2 檢測呈陽性的樣本——比 Zenodo 報告中的多 11 個——還有 112 個樣本呈陰性。

一位未參與這兩項研究的研究人員表示,這些發現支持自然起源假說,並且由​​於圍繞 COVID 起源工作的爭議而希望保持匿名。這位科學家說,許多野生動物物種的存在意味著可能已經發生導致 COVID-19 大流行的病毒溢出。消息人士補充說,其中一些物種,例如浣熊,有可能傳播 SARS-CoV-2 感染。「[在最新論文中] 的間接證據的範圍大於人們可以找到的替代假設的範圍,即它是從實驗室洩漏的。」

COVID 起源研究將貉與武漢市場聯繫起來

該研究還提供了有關市場在大流行起源中的作用的線索。在爆發的最初幾週,SARS-CoV-2 的兩個譜系(稱為 A 和 B)正在傳播。最初,測試僅在市場上確定了譜系 B。這導致一些研究人員得出結論,市場可能只是作為早期「超級傳播者」事件的場所,而不是動物溢出的場所,因為世系 A 被認為更具有祖先性。

但中國疾病預防控制中心去年發布的預印本在一個樣本中確定了譜系 A。「這是真正讓我轉變的結果,讓我真的說,’好吧,它很可能來自市場,’」Débarre 說。但她說有些人質疑結果是否真實。她說,新的分析證實了譜系 A 的存在,解決了這些疑慮。

人類將病毒帶入市場的可能性與動物一樣

加州斯坦福大學的微生物學家 David Relman 同意作者在研究中的評估,即市場可能充當了 SARS-CoV-2 傳播的放大器。「人類將病毒帶入市場的可能性與動物一樣。」香港大學的保護生物學家 Alice Hughes 對分析的質量表示擔憂。休斯說,除了浣熊等動物的基因組片段外,該論文還鑑定了大熊貓、鼴鼠和黑猩猩等動物的遺傳物質。考慮到在中國殺死一隻熊貓會被判死刑,「那個市場上絕對不可能有任何熊貓的踪跡」,她說。

Hughes 說,奇怪的結果可能來自實驗室污染,或數據處理不當未能剔除虛假物種鑑定。「我們在解釋或過於相信這篇論文時必須格外小心。」

Débarre 還質疑結果的各個方面。中國疾控中心的作者使用了兩種基因組分析方法:一種搜索所有可用的基因和基因組,另一種專注於線粒體基因組中的特定序列。Débarre 說,根據 Zenodo 分析和中國疾病預防控制中心的線粒體基因組分析,全基因組方法在一個充滿浣熊核酸的樣本中只檢測到幾個浣熊狗序列。

存在病毒和動物 DNA 並不一定表明動物已被感染

數據並未明確指出特定動物是將病毒傳播給人類的中間宿主。但這位不願透露姓名的研究人員表示,結果再次強調了一些動物,包括浣熊,可以研究它們傳播 SARS-CoV-2 的能力。

Débarre 說,進一步的法醫分析可以揭示 DNA 在拭抹樣本中的動物是否具有免疫系統激活的跡象,這可能表明活動性感染。這可能有助於解決人們的擔憂,即同一樣本中存在病毒和動物 DNA 並不一定表明動物已被感染。但雷爾曼認為,對同一數據集的進一步分析不會得出有關病毒起源的重要答案。「我們真正需要的是其他類型的數據。關於武漢早期臨床事件的良好可驗證數據。」

本文僅代表作者立場,不代表本平台立場

分享文章

Facebook Comments 文章留言

特別報導
特別報導
銳傳媒資料中心

專欄

推薦閱讀